Apabila mencicil maka orang tu mendapatkan biaya tambahan sebesar 5% per tahun dihitung dari USD 3.500. Dengan cara pembayaran dibayar tiga tahun makan pada saat akad wajib membayar USD 2.275 sisanya pada tahap kedua saat awal masuk madrasah Aliyah dengan mengikuti kurs pada sat akad.
Bila ingin dibayar tahunan maka per tahan sebesar Rp11.375.000 untuk enam kali pembayaran.
Bila ingin dibayar per enam bulan yaitu Rp5.687.500,-.
Bila dibayar er bulan maka dikenakan sebesar Rp947.917,- per bulan.
- Biaya listrik Rp25.000,- per bulan dibayar untuk 12 bulan
- Biaya perawatan asrama Rp250 ribu per tahun
- Biaya perlengkapan kamar Rp400 ribu untuk tiga tahun pembelajaran
- Biaya pembuatan buku izin tinggal Rp40 ribu
- Biaya lainnya seperti ujian, buku paket, raihlah, seragam dan lainnya ditetapkan kemudian
- Biaya penunjang seperti pembelian kasur pada saat akad hingga biaya notaris ditetapkan kemudian.
Meskipun dalam kondisi gonjang-ganjing, Pesantren Al-Zaytun masih membuka proses pendaftaran.
Dalam laman profil Pesantren Al-Zaytun dibangun pada 1 Juni 1993 yitu dengan nama Yayasan Pesantren Indonesia.
Pesantren l-Zaytun yang memiliki luas 1200 hektar dengan sarana kompleks seluas 200 hektar. Pesantren Al-Zaytun menamakan dirinya sebagai pesantren yang modern.