Setelah itu, Yudo Margono menjabat sebagai Panglima Kogabwilhan I pada 24 September 2019.
Jabatannya sebagai Pangkogabwilhan I itu membuat karier Yudo makin moncer hingga membawanya menduduki jabatan sebagai KSAL.
Ia menjabat sebagai KSAL ke-27 sejak tanggal 20 Mei 2020 hingga sekarang.
Kariernya terus menanjak saat pemerintah memutuskan untuk memulangkan WNI dari Wuhan di awal pandemi Covid-19 pada 2020 lalu.
Yudo Margono dipercaya memimpin proses rehabilitasi yang dilakukan di hanggar Lanud Raden Sadjad, Natuna.
Selama penanganan Covid-19, Yudo pun dipercaya memimpin operasional RS Darurat Wisma Atlet Kemayoran.
Punya karier mentereng, Laksamana Yudo Margono memperoleh bintang jasa atas kariernya dalam dunia militer.
Daftar bintang jasa peroleh Laksamana Yudo Margono adalah:
Bintang Yudha Dharma Pratama
Bintang Jalasena Pratama
Bintang Yudha Dharma Nararya
Bintang Jalasena Nararya
Satya Lencana Dharma Samudera
Satya Lencana Kesetiaan XXIV
Satya Lencana Kesetiaan XVI
Satya Lencana Kesetiaan VIII