Saat itu, Johan Cruyff mengambil langkah mempromosikan Pep Guardiola ke tim utama Barcelona yang ditinggal Luis Milla ke Real Madrid.
Sejak saat itulah Pep Guardiola gantikan posisi Luis Milla. Mereka sama-sama murid Johan Cruyff yang berbeda jalan.
Pep Guardiola bersama Johan Cruyff di Barcelona, sedangkan Luis Milla melanjutkan karier di Real Madrid.
Bersama Real Madrid, Luis Milla bermain selama 7 musim atau sampai 1997.
Dalam 206 pertandingan bersama Real Madrid, Luis Milla mencetak 4 gol.
Adapun gelar yang Luis Milla raih bersama Real Madrid yaitu dua trofi La Liga Spanyol di musim 1994/95 dan musim 1996/97 dan trofi Copa del Rey musim 1992/93.
Luis Milla kemudian pindah ke Valencia pada musim 1996/97. Saat itu Real Madrid baru menjadi juara La Liga Spanyol.
Di Valencia, Luis Milla bermain hingga 2000/2001. Setelah itu dia gantung sepatu. Pensiun dari karier menjadi pemain sepakbola.
Kemudian Luis Milla menjadi pelatih di klub-klub Eropa termasuk tim nasonal.
Pada gelaran Piala Eropa 2011, Luis Milla membawa timnas Spanyol U-21 menjadi juara.
Kemudian Luis Milla melatih timnas Indonesia dan saat ini menjadi pelatih Persib di Liga 1.